目前中心根据实验模块设计有7组功能实验室，总面积6100平方米，根据功能，对实验室进行专门设计建造，配备标准的教师办公室（20 M ² /间）、实验准备室（60 M ² /间）、学生实验室（60 M ² /间）、大型仪器室（20M ² /间）及储藏室（20-100M ² /间）。

1.      化学与生物化学实验室：教师办公室 4间，实验准备室2 间，特种仪器室 4间，储藏室3间，学生实验室8间，总面积650平方米，配备标准实验台，试剂架及小型仪器设备。主要承担化学、生物化学及生物学相关实验。

2.      人体解剖学实验室：教师办公室5间，人体标本准备室2间，尸体保存储存室5间（含尸库1间，内有尸体池2个），耗材储藏室3间，人体科学馆1间，遗体（器官）捐赠室2间，人体虚拟仿真实验室4间，学生实验室4间，总面积880平方米，其中人体标本准备室主要用于制备福尔马林处理的或者塑化处理的尸体标本，学生实验室配备多媒体教学设备、标准的尸体解剖台、无影灯，实验室采用墙角负压抽风系统，保证实验室空气环境正常。人体仿真实验室配备有虚拟人系统，并与中国科学院合肥物质研究院利用其亚洲第一台高场强磁共振成像设备开发的高仿真、高清晰度人脑组织影像图谱。主要用于开展系统解剖学、局部解剖学及断层影像解剖学等实验。

3.      细胞生物与分子生物学实验室：教师办公室6间，实验准备室1间，特种仪器室4间，储藏室4间，学生实验室8间，总面积670平方米，配备标准实验台，试剂架及PCR仪，离心机，水浴箱，紫外观测仪及电泳仪等小型仪器设备。主要承担细胞生物学、分子生物学及医学遗传学等相关实验。

4.        放射核医学实验室：教师办公室4间，实验准备室2间，特种仪器室3间，放射源保管室1间，放射性废物暂存室1间，学生实验室2间，总面积680平方米，配备标准实验台，液闪等仪器设备，还配有射线防护屏、铅防护服等防护设备。实验室具有辐射安全许可证，具有学生示教用放射源137Cs及V类放射源各一枚，废物专门处置，下水专用。主要承担放射、同位素等相关实验及研究。

5.      人体形态学实验室：教师办公室5间，实验准备室1间，显微镜维护室3间，人体胚胎发育展览室1间,人体病理标本库3间，切片保管室1 间, 学生实验室5间，总面积约880平方米，配备标准实验台，显微镜,多媒体教学设备，数字切片系统,数码互动系统,图片库等.主要承担组织胚胎学、病理学、形态学综合实验等相关实验教学

6.      人体机能学实验室：教师办公室5间，实验准备室4间，虚拟仿真实验室1间,储藏室1间 学生实验室10间，总面积880平方米，配备标准实验台60，多媒体教学设备8套、BL-420生物信息采集系统46套,小动物热板仪12套，氧耗量检测系统24套，微循环检测系统3套,离体器官灌流系统12套,血氧分析仪1套, 小动物行为检测系统等。主要承担生理学、病理生理学、药理学等相关实验及研究。

7.      病原微生物及免疫学实验室：教师办公室5间，实验准备室5间，寄生虫保本制作保管室1间，菌种保存储藏室1间，细菌接种培养室1间，学生实验室5间，总面积790平方米，配备标准实验台，多媒体教学设备、显微镜、生物安全柜，恒温摇床、电泳系统、PCR仪、紫外分光光度计、二氧化碳培养箱、高速冷冻离心机、倒置生物显微镜、厌氧培养箱、人工气候箱、隔水式恒温培养箱等。主要承担寄生虫、微生物、免疫学等教学实验。

8.      虚拟仿真实验平台：利用计算机网络系统，将分布在人体解剖学、形态学、机能学、病原微生物与免疫学、核医学、细胞与分子生物学实验室中的虚拟仿真实验教学模块网联一起，建立虚拟仿真实验平台。用于学生实验教学。

9.      协同创新转化医学实验平台：包括办公室、激光共聚焦实验室、流式细胞仪实验室、活细胞工作站、组织切片及检测系统、膜片钳实验室、质谱仪器室等，总面积480平方米.主要承担本科生研究及开放性实验教学。

学生实验过程的人均使用面积由过去不足1平方米达到现在近3.5平方米，满足了学生实验教学的面积要求，实验室布局和规模极大改善。我校被列入“中西部高等教育基础能力提升工程”建设高校，获得1.67亿项目经费建设医学生综合技能学习中心。建成后，基础医学实验中心面积将达到 12000 M²。届时实验室环境布局将更加合理、设计理念更加先进、智能化信息化程度更高。